一、项目编号：KYJX2025021201
二、项目名称：双生子队列DNA CGA芯片检测
三、成交信息：
供应商名称：上海善准医疗科技有限公司
中标（成交）金额：70万元
四、标的信息：
标的明细
| 服务名称 | 服务范围 | 服务要求 | 服务时间 | 服务标准 |
| 双生子队列DNA CGA芯片检测 | 对 2800例血液样本进行全基因组 CGA 芯片检测（含检测前处理）；需提供完整 的电子版项目数据分析报告（内附数据分析流程及报告说明），检测数据可用于分析个体衰老相关的潜在生物标志物和关键基因等研究分析。 | 1. 服务时间要求 1) 项目周期需在收到样本后 90 天内完成。 2) 需保证 2 年内的样品保存，以及至少 12 个月的检测原始数据保存。 3）对需要返还的剩余样本，需一个月内安排寄送返还。 2. 服务内容要求 1) 为保证样品的质量，需供应商安排冷链运输，并承担样品运输费用。 2) 为保障项目稳定进行，检测项目供应商要求如下： A. 供应商具有不少于 2 台的 Illumina-iSCAN 平台（或其他同等或更优的设备），可以进行 SNP 分析、CNV 分析； B. 项目检测采用针对中国人群特征设计的 Illumina Chinese Genotyping Array（CGA）全基因组分型芯片，检测位点数不少于 68 万（或其他有足够位点交集且性能相当的分型芯片）。 C. 供应商需具备相同或类似基因芯片的检测经验。 3.）检测要求 A. 基于血液样本提取的 DNA 开展完成 DNA 质检。 B. 全基因组基因芯片检测时，DNA 上样量≥300ng。 C. 检测结果需要提供原始芯片信息、质控报告、原始的荧光信号文件、基因分型结果以及分析结果比对至正义链的数据；需要提供完整前处理流程及质控方法的描述。 D. 检出率要求：有效样本数≥250 例，在样本 DNA 质量检测合格的情况下，确保芯片检测数据可读率（call rate）不低于 98%，成功率大于 98%，样本平均 SNP 可读率（call rate）大于 98%，超过 98%的 SNP 可以在所有人中检测到。 E. 重复性验证要求：在检测过程中，采购人额外提供总样品数的 2.5%的重复样品（重复样品不包含在总样品数目中）进行盲测，要求全部样品一批次上机检测，盲测样品重复率大于 99%。 F. 衰老相关位点检出率不低于 95%。 G. 数据产出与交付：检测完成后以云盘或硬盘形式对产出数据及相关附属文件进行交付。提供 Iscan Raw Data 原始数据，包含扫描得到的信号值 IDAT 文件和芯片扫描图片 jepg 文件。提供前处理流程及质控方法（中英文版）等。 4）进度要求 A. 收到样本及信息单的次日起计算，在 5 个工作日内完成样本质检，并提供相应的质检报告；当一次性寄送样本数量大于 2000 个样本时，每增加 500 个样本，质检周期增加 7 个工作日。 B. 从每批样本送到且样本检测合格、采购人确认下单实验后的 90 个日历日内完成合同签订样本数的数据产出，并进行数据相应的数据格式转化及数据筛选。 注：上述周期是指成交供应商收到采购人样品及样本信息单、样品检测合格且采购 人确认建库次日起算，双方沟通时间应从周期中扣除（五一、十一、中秋、春节等 国家法定节假日不计入项目周期）。 5.）数据分析要求 A. 在履约过程中需提供芯片内参质控报告；数据过滤：根据样品检出率、位点检出率、MAF 信息、HWP 值、性染色体、亲缘关系质控及群体分析质控信息进行数据过滤，需明确过滤标准。 B. 需进行全基因组填补（imputation），关联分析（association analysis）、条件分析（condition analysis），并最终提供原始分型结果及填充 后的分型结果标准化数据库。 C. 需协助采购人完成全基因组关联后分析（post-GWAS analysis），包括fine-mapping 分析、Gene ontology 分析、Functional annotation 分析，针对显著关联SNP 位点，通过公开数据库（TCGA、GEO、GTEx）等进行全面的生物功能及分子功能机制注释，基于 HiC、enhancer、TFBS、eQTL、meQTL、pQTL 等综合数据预测评估，进而呈现其潜在的分子调控机制。作为工具变量进行孟德尔随机化(MR)分析。 6）需遵守样品、实验数据信息以及项目相关资料的保密义务，不得将相关数据泄露给第三方。保险期限根据项目需求设定。检测完成后，如样本仍有剩余，应在报告发布后的一个月内全部返回给采购人，由采购人妥善处理。 3. 服务周期 不少于 1 年，需保证至少 12 个月的数据保存。 4. 主要设备要求 为保障数据分析质量和周期，要求供应商计算资源充沛，基本要求总内存1TB或以上，总储存100TB 或以上。 | 2025年2月1日-2025年12月31日 | 符合技术要求和服务要求中所规定的各项内容，提供的芯片数据质量等全部达 到约定标准，并得到需求方确认。 |
五：科研项目负责人：
| 吴凡 |
六、公告期限：
自本公告发布之日起1个工作日。
七、凡对本次公告内容提出询问，请按以下方式联系。
1.采购人信息
名称：复旦大学
地址：中国上海邯郸路220号
联系方式：联系人：陈老师 电话： 021-65645621